培训课表第一节分子动力学基础理论1.1分子动力学基本原理(分子运动论、人工势函数模型)1.2分子动力学关键技术(力场选择、人工时间积分处理、模拟条件控制、数值技巧)1.3分子动力学研究流程(软件选择、建模、能量最小化、模拟、结果分析第二节分子动力学软件建模基础2.1导入模型、基本操作、导出模型2.2由晶体参数构建原胞2.3构建超胞、引入缺陷2.4建立表面、设置真空层2.5草画分子2.6二维材料表面添加指定分子2.7构建石墨烯、MXene等典型二维材料模型2.8构建石墨烯等二维纳米带模型第三节Windows平台分子动力学模拟实践3.1Windows平台分子动力学计算流程详解3.2构建各种体系模拟模型(混合模型、界面模型等)3.3模拟实践:石墨烯二维纳米孔水分子透过离子过滤模拟第四节Linux高性能计算入门+软件安装4.1Linux(CentOS)系统安装(物理机或虚拟机)4.2WinSCP,XShell远程软件安装配置详解4.3Lammps的Windows版+Linux串行/并行版编译安装定制Lammps格式Notepad++编辑器(高亮Lammps文件关键词,让Lammps文件更清晰易读)第五节Lammps操作基础+命令详解5.1Lammps计算所需输入/输出文件构建和命令详解(in文件,data文件,lammpstrj文件结构及格式)5.2Lammps计算流程控制(如何自由地高度自定义计算流程及施加各种外界条件)5.3Lammps力场势函数详解和参数说明(如何针对特定计算体系分析,准确选择力场)第六节Lammps模拟结果后处理/数据分析方法6.1体系能量数据分析(原子受力。
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